阿勒泰地处亚洲大陆腹地，属温带亚干旱大区、干旱大区气候带。由于北边有阿尔泰山脉为屏障，南临准噶尔盆地北沿，因而形成特殊的气候条件，南北气候差异较大。北部山区年降水量大、蒸发量小、冬季积雪多，冬春风少且小于南部、无霜期短，南部平原相反，年降水量小、蒸发量大、冬季积雪少、冬春风多且大、无霜期略长于北部山区。年平均温度5.6摄氏度，常年4.9摄氏度；1月平均气温-12.5摄氏度，常年-15.3摄氏度；7月平均气温21.4摄氏度，常年21.7摄氏度。